L’OGEC fonctionne avec un conseil d’administration qui se réunit tous les mois, en moyenne. Des commissions ponctuelles permettent de gérer des projets spécifiques comme l’accessibilité des locaux au plus grand nombre, quel que soit le handicap (ADAPT). Sont membres de droit du conseil d’administration, la Directrice de l’école, la présidente de l’APEL, et le Directeur Diocésain ou son représentant, le délégué de tutelle.